Графические процессоры обладают огромными вычислительными мощностями, однако для их полной реализации нужна поддержка со стороны соответствующих приложений. Согласно новому пресс-релизу компании Nvidia, её графические карты получили поддержку со стороны четырех приложений: LAMMPS, GROMACS, GAMESS и QMCPACK. Это наиболее популярные приложения для расчетов в прикладной науке и биомолекулярном моделировании. Среди других приложений, используемых в правительственных, промышленных и университетских исследованиях, можно назвать AMBER, NAMD и TeraChem.
«Широкий доступ к дешёвым, энергоэффективным суперкомпьютерным вычислениям позволяет ускорить темпы научных исследований. Такие расчёты позволяют учёным быстрее и точнее симулировать биологические процессы до начала дорогостоящих практических опытов на животных и пациентах».
Приложение GAMESS используется для разработки медикаментов и различных материалов. GROMACS моделирует биомолекулярное взаимодействие между протеинами. LAMMPS создаёт модели биомолекул и полимеров на атомном уровне, и твердотельных материалов, таких как металлы, полупроводники и т.д. QMPACK симулирует свойства материалов, используя квантовую теорию и метод Монте-Карло.
«При молекулярном моделировании перед исследователями стоит титаническая задача по моделированию бесчисленного множества состояний и вариантов. Эта задача может быть значительно упрощена при использовании кластеров графических процессоров». Теперь, когда эти программы поддерживают параллельную работу GPU, работа по созданию новых медикаментов и материалов значительно ускорится.
Источник: OsZone
|
